UTSC’de geliştirilen, küçük protein moleküllerinin 3 boyutlu yapılarını üretebilen yeni bir “öğrenen makine algoritmaları”, bir dizi hastalık için ilaç tedavilerinin geliştirilmesinde devrim yaratabilir.
Algoritmaları geliştirmeye yardım eden UTSC PhD öğrencisi Ali Punjani, “Başarılı ilaçlar tasarlamak, bir bulmaca çözmek gibidir. Bir proteinin üç boyutlu şeklini bilmeden, o bulmacanın gözü kapalı bir şekilde çözülmeye çalışılması gibi olur.
Protein moleküllerinin 3D atom yapısını belirleme kabiliyeti, nasıl çalıştığını ve ilaç terapilerine nasıl tepki vereceğini anlamada kritik önem taşıyor.” diyor.
İlaçlar, belirli bir protein molekülüne bağlanarak, vücudun çalışma biçimini değiştirip, 3D ‘a dönüştürüyor. İdeal ilaç, vücuttaki diğer proteinlere bağlandığında, oluşacak olan yan etkileri ortadan kaldırırken, belirli bir proteine veya bir hastalığa dahil olan proteinlere bağlanacak şekilde tasarlanıyor.
Bu yeni algoritma seti, protein moleküllerinin 3D yapılarını mikroskobik görüntüler kullanarak yeniden oluşturur. Proteinler küçük olduğu için -bir dalga boyu ışığından daha küçük – elektron kriyomikroskopisi (cryo-EM) gibi gelişmiş teknikler kullanmadan doğrudan görülemez.
Bu yeni yöntem, bilim insanlarının geçmişte incelenemeyen birçok proteinin incelenmesine olanak tanıyan, 3D protein yapılarını keşfetmesinde devrim yaratıyor.